شناسايي و تجزيه و تحليل ميكرو ار.ان.آها در گونه‌هاي مختلف آويشن (Thymus)

اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان

كشاورزي

كارشناسي ارشد

چكيده امروزه گياهان دارويي به دليل متابوليت‌هاي مؤثر آن‌ها در درمان بسياري از بيماري موردتوجه همگان قرارگرفته‌اند. يكي از اين گياهان آويشن نام دارد كه حاوي گستره وسيعي از متابوليت‌هاي ثانويه مي‌باشد. از جمله اين مواد به ترپن‌ها و فلاونوييدها و آنتي‌اكسيدان‌ها مي‌توان اشاره كرد. تكنيك‌ها و روش‌هاي مختلفي براي افزايش و توليد اين مواد ابداع‌ شده است. در روش‌هاي كلاسيك عوامل محيطي دستخوش تغييرات قرار داده مي‌شود تا بيشترين ماده مؤثر در گياهان دارويي توليد شود اما در رويكرد‌هاي جديد‌تر كه مبتني بر ژنتيك گياه هستند بازده بالاتر مشاهده مي‌شود. از جمله اين رويكرد‌ها استفاده از miRNAs مي‌باشد. miRNAs يك رده از RNAs تنظيم‌كننده كوچك درون‌هسته‌اي و غيركدكننده پروتئيني هستند كه متشكل از حدود 17-24 نوكلئوتيد مي‌باشند. miRNAs بيان ژن را پس از رونويسي از طريق تجزيه mRNA يا مهار ترجمه آن‌ها كنترل كرده و نقش‌هاي متنوعي را در فرايندهاي بيولوژيكي و متابوليكي در گياهان و جانوران بازي مي‌كنند. روش‌هاي متعددي براي شناسايي miRNAs موجود مي‌باشد كه يكي از ساده‌ترين و كم‌هزينه‌ترين آن‌ها، روش شناسايي بيوانفورماتيكي مي‌باشد. در اين مطالعه با هدف شناسايي miRNA متمايز در گياه آويشن، مطالعه‌اي مبتني بر جستجوي همولوژي بين اطلاعات ترانسكريپتومي گياه آويشن و miRNA انجام گرفت. بطوريكه ابتدا اطلاعات ترانسكرپتومي گياه آويشن پالايش شدند و سپس با انجام بلاست در برابر تمام miRNAs شناخته‌شده موجود در بانك اطلاعاتي miRBase انجام شد و در نهايت 64 miRNA كانديد متمايز در گونه‌هاي مختلف گياه آويشن شناسايي شد. ژن‌هاي هدف شناسايي‌شده با استفاده از نرم‌افزارهاي مختلف موردبررسي قرار گرفتند. از اين تعداد 14 عدد در مسير‌هاي سنتزي ترپن‌ها مشاهده شدند.

212224

بيوتكنولوژي

مهندسي كشاورزي

دانشگاه صنعتي اصفهان

مجيد طالبي، امير مساح

ابوذر سورني