آناليز ترانسكريپتوم موسير به‌منظور شناسايي ژن‌هاي كليدي دخيل در متابوليسم سولفور

اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان

كشاورزي

كارشناسي ارشد

چكيده آليوم يكي از جنس‌هاي شناخته‌شده از خانواده Amaryllidaceae است كه داراي بيش از 780 گونه است. پياز، سير، تره‌فرنگي و موسير مهم‌ترين گونه‌هاي اين تيره هستند. Allium hirtifolium (موسير) منبعي غني از پروتئين‌ها، كربوهيدرات‌ها، ليپيدها، اسيدهاي آمينه و تركيبات فعال زيستي مانند تركيبات گوگرد آلي با طيف گسترده‌اي از فعاليت‌هاي بيولوژيكي و ويژگي‌هاي دارويي است. براي شناسايي تركيبات و ژن‌هاي احتمالي درگير در مسير گوگرد آلي، تكنيك‌هاي RNA-seq براي بافت‌هاي كورم، ساقه و گل گياه A. hirtifolium اعمال شد. پروفيل ترانسكريپتوم به ترتيب 6155، 6494 و 4259، DEGs را براي كورم در مقابل گل، كورم در مقابل ساقه و گل در مقابل ساقه نشان داد. به‌طوركلي، ژن‌هاي بيشتري در بافت گل در مقايسه با بافت ساقه و كورم به‌عنوان بيش بيان‌شده شناسايي شدند. يافته‌هاي ما مطابق با نتايج ديگر از مقالات مختلف، نشان مي‌دهد كه كربوهيدرات‌ها براي شكل‌گيري و توسعه كورم حياتي هستند، زيرا تعداد زيادي از DEGs شناسايي‌شده (586 ژن) براي متابوليسم كربوهيدرات ترسيم‌شده‌اند. اين مطالعه ژن‌هاي موجود در مسير سنتز گوگرد آلي را شناسايي كرده و نشان داد كه ژن آليناز تنوع بالايي در بين بافت‌هاي مختلف نشان مي‌دهند. به‌طوركلي، اين مطالعه اطلاعات مفيدي را براي كشف مسير گوگرد خاص بافت در A. hirtifolium تشكيل داد كه براي اصلاح عملكرد مفيد است.

212226

بيو تكنولوژي كشاورزي

مهندسي كشاورزي

دانشگاه صنعتي اصفهان

ابراهيم بدرالدين طباطبايي

محمد مهدي مجيدي، آذر شاهپيري

ابوذر سورني