عنوان
شناسايي، تجزيه و تحليل عملكردي و بررسي پروفايل بياني ژن هاي خانواده‌ي Aux/IAA در اسفناج
نويسنده اصلي
ايماني اصل، عرفان
محل تحصيل
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
رشته تحصيلي
بيوتكنولوژي كشاورزي
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
چكيده
ژن‌هاي آكسين-3- ايندول استيك اسيد، ژن‌هاي اوليه پاسخ‌دهنده به اكسين هستند كه براي انتقال سيگنال اكسين و رشد و نمو گياه ضروري مي¬باشند. با توجه به اهميت اين خانواده ژني و نبود اطلاعات كافي در مورد آن¬ها در گياه اسفناج، پژوهشي به منظور شناسايي و بررسي عملكرد اين خانوده ژني طراحي و اجرا شد. در اين تحقيق با استفاده از مدل پنهان ماركوف، 24 ژن Aux/IAAs در ژنوم اسفناج شناسايي و متعاقباً بررسي و ارزيابي شدند. بررسي موقعيت و پراكنش ژن¬ها نشان داد كه بيشترين تعداد ژن (11 ژن) بر روي كروموزوم شماره 4 وكمترين تعداد ژن (1 ژن) برروي كروموزوم شماره 1 قرارگرفته‌است. در اين راستا نيز يك تجزيه و تحليل جامع از 24 ژن Aux/IAAs با استفاده از پنج دامنه حفاظت شده انجام شد. نتايج نشان داد كه دامنه دو، دامنه غالب در بين ژن‌ها محسوب مي¬شود، لذا مي¬تواند به عنوان شاخصي براي شناسايي اعضاي اين خانواده مورد استفاده قرار گيرد. در اين مطالعه روابط فيلوژنتيك 24 ژن Aux/IAAs اسفناج با 29 ژن در آرابيدوپسيس، 30 ژن دركاهو و 49 ژن در تربچه نيز بررسي‌شد. بر اساس نتايج تجزيه و تحليل فيلوژنتيك، ژن¬هاي درخت مورد نظر در 10 كلاد قرارگرفتند. در هركلاد روابط ارتولوگ و پارالوگ بين ژن‌هاي Aux/IAAs شناسايي شدند و عملكرد ژن‌هاي Aux/IAAs اسفناج و آرابيدوپسيس بر اساس روابط فيلوژنتيكي مقايسه و بررسي شدند. با توجه به نتايج درخت، رابطه ارتولوگي بين برخي ژن‌هاي Aux/IAA در آرابيدوپسيس و اسفناج مشاهده شده است كه در كلاد سوم SpoIAA2 با AtIAA31، در كلاد ششم SpoIAA1 با AtIAA27 ، در كلاد هشتم SpoIAA4 با AtIAA1و در كلاد نهم SpoIAA3 با AtIAA5 ارتولوگ همديگر بودند. آناليز بيان ژن چهار ژن Aux/IAAs با استفاده از واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز كمي در چهار مرحله رشدي دو، چهار، شش و هشت برگي مورد تجزيه و تحليل قرارگرفت. نتايج نشان داد كه سه ژن SpoIAA1، SpoIAA3 و SpoIAA4 در مرحله هشت برگي بيشترين سطح بيان را دارند. نتايج حاصل از اين مطالعه بينش عميقي را در مورد الگوهاي بيان Aux/IAA ارائه مي‌دهد و اطلاعات پايه‌اي براي آشكار كردن عملكرد بيولوژيكي ژن‌هاي Aux/IAAs در اسفناج فراهم مي¬كند.
شماره ركورد
222444
گرايش رشته تحصيلي
بيوتكنولوزي كشاورزي
دانشكده
مهندسي كشاورزي
دانشگاه
دانشگاه صنعتي اصفهان