مطالعه ژن ها و مناطق كروموزومي شناسايي شده مسئول براي صفات عملكردي و توليد مثلي در گوسفند: فراتحليل پويش كل ژنوم

اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان

مهندسي كشاورزي- علوم دامي

كارشناسي ارشد

به منظور بررسي ژن¬ها و مناطق كروموزومي شناسايي شده مسئول صفات عملكرد توليد مثلي در گوسفند، مطالعه¬ فراتحليلي پويش كل ژنوم انجام شد. بدين منظور با استفاده از كليد واژه¬هاي فارسي و معادل لاتين آن¬ها از جمله ژن، كروموزوم، SNP، GWAS، مناطق كروموزمي، گوسفند، صفات عملكردي و صفات توليد مثلي در پايگاه¬هاي انگليسي زباني PubMed، Scopus، Web of Science و Google Scholar و فارسي زبان Irandoc، SID، Magiran و Civilica مقالات مورد نظر استخراج و سپس وارد نرم افزار اندنوت گرديد. پس از حذف مقالات تكراري و مقالات فاقد اطلاعات مورد نظر، در نهايت 35 مطالعه وارد نرم افزار R نسخه 1.4.4 گرديد. به منظور تجزيه و تحليل داده¬هاي به دست آمده از بسته metafor و qqman استفاده شد. نمودار صفات گروه وزن در اين مطالعه نشان داد كه بيشترين تعداد اسنيپ ابتدا بر روي كروموزوم 6 و بعد از آن كروموزوم X و بعد از آن بر روي كروموزوم 3 قرار دارد و كمترين اسنيپ¬هاي مشاهده شده بر روي كروموزوم 24 است. نمودار صفات گروه توليد مثل نشان داد كه بيشترين تعداد اسنيپ ابتدا بر روي كروموزوم 1 و بعد از آن كروموزوم 2 و 3 قرار دارد. همچنين كمترين تعداد اسنيپ در اين گروه بر روي كروموزوم 16 قرار داشت. بيشترين تعداد اسنيپ¬ها براي صفات گروه شيردهي ابتدا بر روي كروموزوم 2 و سپس شماره 1 و بعد از آن شماره 3 قرار دارد. همچنين كمترين تعداد اسنيپ¬ها بر روي كروموزوم 23 مشاهده گرديد. نتايج مربوط به منهتن پلات براي صفت وزن تولد چهار اسنيپ OAR2_51716542.1، OAR12_20575087.1 ،OAR17_29260298.1 و s03219.1 را معني¬دار نشان دادند كه به ترتيب بر روي كروموزوم¬هاي 2، 12، 17و18 قرار داشت. براي صفت وزن از شيرگيري دو اسنيپ rs421690996 و rs409558668 كه به ترتيب بر روي كروموزوم¬هاي 22 و 16 قرار داشتند معني¬دار مشاهده گرديدند. براي صفت افزايش وزن روزانه قبل از شيرگيري اسنيپ OAR10_91128145.1 كه بر روي كرموزوم 10 قرار داشت معني¬دار اما براي افزايش وزن روزانه پس از شيرگيري اسنيپ معني¬داري مشاهده نگرديد. براي صفت افزايش وزن روزانه و وزن صفت بدن اسنيپ rs414911966 و s45224.1 كه به ترتيب بر روي كروموزوم 20 و 1 قرار داشتند معني¬دار مشاهده گرديد. همچنين براي وزن يك¬سالگي اسنيپ¬هاي OAR6_27552838.1، OAR8_39977285.1، OAR5_84496122_X.1، oar3_OAR9_42035112، oar3_OAR20_22070146 و s12060.1 كه بر روي كروموزوم¬هاي 6، 8، 5، 9، 20 و1 قرار داشتند معني¬دار مشاهده گرديدند. براي صفت توليد مثلي اندازه بره متولد شده اسنيپ s50067.1 واقع بر روي كروموزوم 2 و براي صفت دو قلوزايي اسنيپ OAR3_233748114.1 واقع بر روي كروموزوم 3 معني¬دار شد. براي صفات توليد و تركيبات شير از جمله درصد پروتئين و مقدار چربي اسنيپ معني داري مشاهده نشد اما براي صفت درصد چربي دو اسنيپ rs425417915 و OAR3_147028849 كه به ترتيب بر روي كروموزوم¬هاي 7 و 3 واقع قرار داشتند معني¬دار بودند.

232074

ژنتيك و اصلاح نژاددام و طيور

مهندسي كشاورزي

دانشگاه صنعتي اصفهان